RNA İçin Geliştirilen Yeni İlaç Keşif Aracı

Bir grup bilim insanı, çözülemeyen proteinleri atlayan ve bunun yerine bunların yapımında ve düzenlenmesinde yer alan unsurları değiştiren bir ilaç keşif platformu icat ettiklerini bildirmişlerdir. Chem-CLIP-Fragment Mapping adlı bu yeni araç, RNA'ya odaklanmakla birlikte teknoloji, Scripps Research, ABD'deki bilim insanları tarafından geliştirilmiştir. Araştırmacılar, kısa ömürlü bir varoluşun, değişken şekil ve sınırlı bir dizi yapı taşı içeren zorluklar nedeniyle, RNA'ların yakın zamana kadar ilaç hedefi olarak görülmediğini belirtmişlerdir. Yeni RNA ilaç keşif aracı, RNA hedefleyen bileşiklerin hem hızlı keşfini hem de optimizasyonunu sağlamak için bu ve diğer zorlukları ele almaktadır. Aracı geliştiricilerinden biri olan Dr Matthew Disney, bunun, birden fazla endikasyonda kurşun ilaçlar yapmalarını sağlamak için çok zorlu moleküler tanıma problemlerinin üstesinden gelmelerine olanak tanıdğını belirtmiştir. Disney, bunun, gerçekten kurtarılamaz olanı yeniden tanımlamak için büyük bir potansiyel sunduğunu sözlerine eklemiştir. Sistem, ümit verici şablonları ortaya çıkarmak için zayıf bir şekilde bağlanan, ilaç benzeri kimyasal parçalar kullanan protein hedefleyen ilaç keşfinde son zamanlarda bir ilerlemeyi uyarlamaktadır. Araştırmacılar parçaların işlevselleştirilir veya etiketler ve ışığa duyarlı modüller ile eklenmekle birlikte bunların görülmesine ve tanımlanmasına olanak tanıdığını belirtmişlerdir. Sistemin RNA ile kullanım anahtarını, Disney’in laboratuvarında on yıldan fazla bir süredir oluşturulan teknolojiler ve veritabanları oluşturmaktadır. Disney, Chem-CLIP-Frag-Map sisteminin ilaç keşfi çabasını hızlandırdığını çünkü RNA hedeflerini bağlamak ve dolayısıyla değiştirmek için birden fazla fırsat ortaya çıkardığını açıklamıştır. Bu durum, bilim insanlarının daha sıkı bir şekilde bağlanması, daha spesifik olması ve hedef dışı yan etkilere daha az yatkın olması için en başından zamandan tasarruf etmesine yardımcı olmaktadır. Disney, bu iki şeyin işbirliği içinde birbirine bağlandığını ve bu nedenle bütün, parçalardan daha iyi olduğunu ifade etmiştir.

Chem-CLIP-Frag-Map aracı

Chem-CLIP-Frag-Map aracı, ultraviyole (UV) ışığa maruz bırakılarak RNA'ya kovalent olarak çapraz bağlanan diazirin grubu adı verilen ışığa duyarlı bir modül kullanarak çalışmaktadır. Disney, bunun, yakındaki diğer moleküllere karşı zayıf mıknatıs benzeri çekiciliği olan bir kimyasal olduğunu, dolayısıyla, hastalıkla ilişkili proteinlerin veya şimdi RNA'ların yanına yerleştirildiğinde, onlara bağlanabileceğini ve bir ilacın bu hastalıkla ilişkili proteine ​​veya RNA'ya bağlanmak için alması gereken şekli ortaya çıkarabileceğini belirtmiştir. Ekip, araçlarını test etmek, üçlü negatif meme kanserini içeren önemli bir RNA olan microRNA-21 için bileşikler bulmak üzere Chem-CLIP-Frag-Map kullandıklarını bildirmişlerdir. İlk yazar Blessy Suresh, sistemin, başlangıç ​​fragmanlarına kıyasla daha yüksek seçicilik ve potansiyele sahip biyoaktif kompleksler tasarlamak için fragmanları optimize etmelerine yardımcı olduğunu belirtmiştir. Blessy, sadece birkaç saat içinde 460 parça tabanlı probu görüntüleyebildiklerini ve bu tarama yönteminin, çok daha yüksek verimli bir formata kolayca ölçeklendirilebileceğini sözlerine eklemiştir. Disney, insan DNA'sında kodlanan her protein için, kodlanmış 75 veya 80 RNA türü olduğunu, bu nedenle bu yeni aracın, üçlü negatif meme kanseri de dahil olmak üzere şu anda kurtarılamaz olarak kabul edilen neredeyse tüm hastalıklar için büyük bir umut sunduğunu belirtmiştir.