Ultra Stabil Kronik Lenfositik Lösemi Hastalarının Genetik Durumu Nasıldır?

Kronik lenfositik lösemi (KLL), iyi bilinen prognostik etkileri olan immünogenetik belirteçlere bağlı son derece heterojen bir klinik seyir gösterir. Başlangıçta genellikle acil tedavi gerektiren agresif hastalığı olan olguların yanı sıra (mutasyona uğramamış IGHV genleri, ATM/TP53 bozulması), hastalığın ilerlemesini takip eden ilk ağrısız fazı olan hastalar ve her ikisi de genellikle mutasyona uğramış IGHV genleri ve uygun bir FISH profili ile karakterize olan, on yıllarca veya hiç ilerleme göstermeyen diğer hastalar vardır.

Yeni nesil sekanslama (NGS) teknolojileri, esas olarak NOTCH1, SF3B1, MYD88 ve BIRC3 genlerini etkileyen önceden bilinmeyen genetik lezyonları tanımladı; FISH anormallikleri ile entegrasyonları KLL hastalarının prognostik gerginliğini daha da artırdı. Daha yakın zamanlarda, tedavi edilmemiş KLL'de TP53 mutasyona uğramış alt klonların varlığı, klonal TP53 lezyonlarının aynı kötü prognostik etkisiyle ilişkilendirildi. Ayrıca, genom çapında kopya sayısı sapması (CNA) çalışmalarından kaynaklanan veriler, KLL klinik sonucunda rol oynayan ek genetik lezyonları tanımladı. Daha önce, tanıdan 10 yıldan fazla bir süre boyunca ultra-stabil hastalığı (US-KLL) olan hastaların ayırıcı biyolojik profili hakkında rapor verildi. Bu çalışmada, bu spesifik alt grubun genetik manzarasını araştırılması için 40 US-KLL vakasına tüm ekzom sekanslama (WES), ultra derin sekanslama ve CNA analizi uygulandı. US-KLL hastalarını tanı için uygun bir immünojenetik proleve sahip vakalar arasında tanıyabilen bir gen imzasını tanımlamak için bir mikrodizi analizi yapıldı.

US-KLL Hastalarının Tanısında Karar Ağacı Oluşturma

Kronik lenfositik lösemi (KLL) heterojen bir klinik seyir gösterir. Acil tedavi gerektiren hastaların yanı sıra, diğerleri başlangıçta sakin bir evre izler ve bunu progresyon izler ve diğerleri on yıllarca ilerleme göstermez. Son iki alt grup genellikle mutasyona uğramış IGHV genleri ve uygun bir FISH profili gösterir.

Tanıdan sonra 10 yıldan fazla (10-34) hastalık ilerlemesi olmayan hastalar, ultra-stabil KLL (US-KLL) olarak tanımlandı. 40 US-KLL, keşfedilmemiş genetik manzaralarını tanımlamak için tüm ekzom sekanslama (WES), ultradeep sekanslama ve kopya sayısı sapması (CNA) analizi gibi kapsamlı karakterizasyona tabi tutuldu. US-KLL ile US-KLL olmayan benzer immünojenetik özellikler (mutasyona uğramış IGHV / uygun FISH) karşılaştırılarak mikroarray analizi de tanı sırasında US-KLL'yi tanımak için yapıldı. Çalışmanın bulgularına göre, WES 20 US-KLL'de yapıldı ve 78 gende 84 sessiz olmayan somatik mutasyon bulundu. 20 US-KLL'lik bir validasyon kohortunda tekrar test edildiğinde tekrarlayan lezyon saptanmadı. ATM ve diğer potansiyel ilerleme tahrik mutasyonları dahil NOTCH1, BIRC3, SF3B1 ve TP53'ün klonal mutasyonları bulunmadı. CNA analizi, hiçbiri kötü prognostik etkisi olmayan 31 lezyon saptamıştır. Yeni rekürren lezyon saptanmadı: olguların çoğunda lezyon (% 38) veya izole del (13q) (% 31) görülmedi. Mikroarray ile bir gen ekspresyon profili analizinden seçilen ve 79 KLL (58 US-KLL ve 21 US-KLL olmayan) hastasını içeren bir kohortta damlacık dijital PCR ile nicelenen 6 genin ekspresyonu, US-KLL hastalarının tanısında belirleyici etkisi olan bir karar ağacı oluşturmaya olanak sağladı.

Sonuç olarak, US-KLL'nin genetik yapısının, bilinen olumsuz sürücü mutasyonlarının / CNA'nın ve yeni tekrarlayan genetik lezyonların olmaması ile karakterize olduğu söylenebilir. Uygun immünogenetiği olan KLL hastaları arasında, 6 genin ekspresyonuna dayanan bir karar ağacı, onlarca yıldır rahatsız edici bir hastalığı sürdürmesi muhtemel tanı hastalarında belirlenebilir.